色譜柱使用一段時(shí)間后，常遇到柱子被污染，柱效會(huì )有一定程度的下降，采用適當的方法對色譜柱進(jìn)行保護，可以延長(cháng)色譜柱的使用壽命。

　　樣品和流動(dòng)相的處理：溶解的樣品進(jìn)樣前用濾膜過(guò)濾以除去不溶物。如果必要，需進(jìn)行樣品的預處理。流動(dòng)相中如有不純物質(zhì)將影響柱效，所以溶劑盡量使用色譜級別的，至少是分析純級別,流動(dòng)相使用前用微孔薄膜過(guò)濾。在流動(dòng)相的管前安裝過(guò)濾器，過(guò)濾器定期用甲醇聲清洗，如果效果不好，可用10%的稀硝酸浸泡清洗。對于堵塞嚴重的過(guò)濾器，可在火焰上灼燒后再清洗。

　　保護柱(預柱)的使用：對于較昂貴的色譜柱，可以在柱前加一保護柱，防止樣品中雜質(zhì)污染分析柱，對于制備柱，因其進(jìn)樣量大，使用保護柱尤為重要。

　　常規處理：硅膠、氧化鋁、性鍵合相色譜柱每一次用完后用低流速長(cháng)時(shí)間的二氯甲烷或正己烷等溶劑沖洗。鍵合相硅膠色譜柱、離子交換色譜柱和凝膠色譜柱用蒸餾水沖洗，再用甲醇沖洗，然后用甲醇與蒸餾水以一定比例混合的溶液沖洗后過(guò)夜。

　　對于已使用一段時(shí)間后柱效下降的色譜柱可按以下方法進(jìn)行再生：再生處理包括活化(右→左)和凈化(左→右)兩種。硅膠、氧化鋁、性鍵合相色譜柱按下列順序沖洗：*基戊烷或己烷←→三氯乙烷←→乙酸乙脂←→丙酮←→乙醇←→水。鍵合相硅膠柱：蒸餾水←→甲醇(沖洗過(guò)程中可加入少量二甲基甲酰胺)。離子交換樹(shù)脂柱：濃度的NaCl溶液(1-2molL的NaCl溶液)可使大部分樹(shù)脂再生，油脂等少數與樹(shù)脂緊密結合的物質(zhì)可用低濃度堿溶液(如0.1molL的NaOH溶液)沖洗，酸性有機物吸附在固定相的用低pH緩沖液沖洗，堿性有機物用pH緩沖液沖洗，然后再用蒸餾水←→甲醇←→二氯甲烷←→甲醇←→蒸餾水沖洗。

　　凝膠色譜柱：由于凝膠色譜柱是根據被分離物質(zhì)的分子量大小而分離物質(zhì)，通常用稀的氫氧化鈉或非離子型去垢劑(0.2%-1%NP-40或Lubrol)沖洗可除去大部分的結合物質(zhì)，如果一些污染物仍然不能清除時(shí)，用24%或30%乙腈沖洗過(guò)夜可除去疏水蛋白，用30%-50%乙酸可除去親水蛋白，用蛋白水解酶處理可分解凝膠中剩余的痕量胃蛋白酶，然后再用蒸餾水←→甲醇←→蒸餾水沖洗。

　　已污染的色譜柱的處理：因保留的物質(zhì)污染，流動(dòng)相或樣品中不溶物沉積于柱頭，可用下列方法洗滌：去除脂類(lèi)可用四氫呋喃、乙腈或甲醇洗滌；去除蛋白質(zhì)可用乙腈、丙醇和1%三氯乙酸進(jìn)行梯度洗脫；一些疏水性化合物可用乙腈或甲醇洗脫，同時(shí)反復注入100-200ml的四氫呋喃。

　　柱頭處理：對于柱頭堵塞污染嚴重的情況而且用溶劑沖洗無(wú)效的色譜柱，只有打開(kāi)柱子去除柱頂的填料重裝：拆下不銹鋼燒結過(guò)濾器，檢查柱床，常見(jiàn)凹陷或受污染的帶色填料，剔去不規則床層和帶色填料，使柱床顯白色并*水平，再用甲醇作糊狀填料勻漿液，將糊狀填料勻漿液滴在柱上靠重力從勻漿液中排出甲醇液，重復直到填料水平。

　　柱子的貯存：首柱子必須清洗干凈后才能貯存，柱子不能貯存在水或水性溶劑中，否則會(huì )引起微生物的滋生。性色譜柱可用適當溶劑如二氯甲烷沖洗；鍵合相色譜柱用甲醇沖洗；陰離子交換色譜柱用0.002%洗必泰(雙氯苯雙胍己烷)的緩沖液沖洗；陽(yáng)離子交換色譜柱用0.005%硫柳汞緩沖液沖洗；凝膠色譜柱用緩沖液中加0.02%*或用20%乙醇沖洗。再將柱子兩頭密封，以防止溶劑蒸發(fā)使柱子干燥而引起柱子結構的幾何學(xué)改變。